Úrad na ochranu oznamovateľov vznikol v roku 2019 počas vlády Petra Pellegriniho. Tá nominovala Zuzanu Dlugošovú na post predsedníčky úradu na základe odporúčania odbornej komisie dvakrát, v júni a októbri 2019. Vedúcim úradu vlády bol v tom čase Matúš Šutaj Eštok a Progresívne Slovensko bolo mimoparlamentnou stranou. Počas tohto volebného obdobia sa post predsedu úradu na ochranu oznamovateľov nepodarilo obsadiť. Zuzanu Dlugošovú zvolil až nový parlament vo februári 2021 počas vlády Igora Matoviča.

Úrad na ochranu oznamovateľov protispoločenskej činnosti vznikol na základe zákona, ktorý parlament schválil v januári 2019 počas vlády Petra Pellegriniho. Zákon bol schválený na základe vládneho návrhu. 

Šéfa alebo šéfku úradu na ochranu oznamovateľov volí a odvoláva parlament spomedzi kandidátov či kandidátok navrhnutých vládou.

V júni 2019 päťčlenná komisia odporučila vláde dve kandidátky – Moniku Filipovú a Zuzanu Dlugošovú. Komisia vypočula 11 uchádzačov a uchádzačok. Komisiu tvorili zástupcovia prezidenta, vlády, ombudsmanky, Rady pre štátnu službu a poradného orgán vlády v oblasti mimovládnych organizácií a rozvoja občianskej spoločnosti.

Kandidátky boli po odporúčaní komisie schválené vládou, parlament o nich hlasoval 26. a 27. júna 2019, ani po opakovanej voľbe nezvolil žiadnu z kandidátok, väčšina poslancov a poslankýň sa zdržala.

Úrad vlády v októbri 2019 zorganizoval ďalšie kolo vypočúvaní rovnakou komisiou. V decembri 2019 vláda Petra Pellegriniho odporučila Martina Rajňáka a po druhýkrát Zuzanu Dlugošovú, parlament o nich však nehlasoval.

Predsedníčku úradu zvolil až nasledujúci parlament vo februári 2021, Dlugošovú podporilo 80 poslancov a poslankýň. Aj v tomto období bolo Progresívne Slovensko mimoparlamentnou stranou, predsedom vlády bol Igor Matovič a úrad vlády viedol Július Jakab z OĽaNO (dnes Slovensko).