Daniel Lipšic sa k dôkazom proti objednávateľom vraždy Jána Kuciaka vyjadroval počas vyšetrovania striedmo, presvedčenie, že dôkazy jasne svedčia o vine, vyjadril až v júli a neskôr v septembri. Tvrdenie Ľuboša Blahu hodnotíme ako ešte pravdivé.  Pri vykonávateľoch vraždy (Marček, Szabó, Andruskó) Lipšic v decembri 2019 hovoril Lipšic o „zrejmej a evidentnej” dôkaznej situácii v ich neprospech (1:00:10). 19. augusta 2019, teda ešte pred podaním obžaloby, povedal, že „si myslí(m), že podozrenie, že Marian Kočner bol objednávateľ sa v priebehu vyšetrovania prehĺbilo a potvrdilo” (6:13). Na otázku, či bude Marian Kočner za objednávku vraždy odsúdený, Lipšic v januári 2020 odpovedal: „Nechcem ja hovoriť dopredu, kým nie je vykonané celé dokazovanie, kto bude alebo nebude odsúdený.” (0:30)  23. júla 2020 Lipšic vyjadril názor, že v prípade obžalovaných „sú splnené zákonné podmienky na uloženie doživotného trestu” (10:00). V záverečnej reči vyjadril presvedčenie, že sústava nepriamych dôkazov usvedčuje Mariana Kočnera zo spáchania skutku. 27. júla 2020 Lipšic na svojom facebookovom profile napísal, že „vo vzťahu k obžalovanému Mariánovi Kočnerovi však existuje „sieť“ – teda dvojdimenzionálny útvar – nepriamych, vzájomne sa dopĺňajúcich a ničím nenarušených dôkazov, ktoré sa navzájom prelínajú, dopĺňajú, a vo svojom celku spoľahlivo dokazujú len jediný rozumný záver. Záver o jeho vine na spáchanom skutku.” V reakcii na oslobodzujúci rozsudok 3. septembra Lipšic povedal, že je presvedčený, že obžaloba ponúkla sieť nepriamych dôkazov, ktoré postačovali na uznanie viny. Podľa neho boli nepriestrelné, logicky ucelené a nespochybniteľné.