Podľa zistení Európskej komisie uvedených v liste ministerstvu pôdohospodárstva sú viaceré pochybenia na Poľnohospodárskej platobnej agentúre systémového charakteru. Komisia konštatuje, že finančné záujmy Únie nie sú dostatočne chránené. Upozorňuje na to, že PPA nie je schopná odhaľovať konflikty záujmov a nedokáže vymáhať peniaze udelené neoprávnene. Výrok Richarda Takáča preto hodnotíme ako nepravdivý.

Európska komisia vykonala audit PPA v októbri 2025. Následne o svojich záveroch informovala ministerstvo pôdohospodárstva listom, ktorý obsahoval všetky hlavné zistenia o nedostatkoch v administrácii poľnohospodárskych dotácií platobnou agentúrou.

Viaceré z kľúčových zistení spomínaných v liste sú systémového charakteru. Hlavným zistením je, že kontrolný systém agentúry je závadný, čo spôsobuje, že únijné peniaze nie sú dostatočne chránené.

Komisia napríklad upozorňuje, že PPA nemá dostatočné mechanizmy na zisťovanie konfliktov záujmov a nedokáže odhaľovať prepojenia medzi firmami. Týka sa to napríklad riaditeľa sekcie vnútornej kontroly PPA Tomáša Hyčka, ktorý sa do funkcie mal dostať neštandardne a zároveň vo svojom životopise zamlčal konflikt záujmov, keďže má prepojenia na niektorých poberateľov dotácií.

Audit ďalej konštatuje, že PPA nedokáže vymáhať peniaze, ktoré boli vyplatené neoprávnene. Aj keď agentúra zistí porušenie pravidiel, často nepožaduje vrátenie peňazí, prípadne ruší už udelené sankcie. V liste Komisia tieto prípady označila za zlyhanie nielen PPA, ale aj iných štátnych orgánov.

Komisia sa tiež v audite odvoláva na audit NKÚ z roku 2025, ktorý konštatuje, že hoci má PPA formálne nastavené protikorupčné opatrenia, v praxi nefungujú, a zároveň naznačuje, že tento systém zostáva iba “na papieri” primárne preto, aby PPA spĺňala kritéria Európskej komisie na získanie akreditácie. Podľa Komisie platobná agentúra výsledky tohto auditu nedostatočne zohľadnila.

Problémom má byť aj novela zákona o podmienkach vyplácania podpôr z poľnohospodárskych fondov EÚ, ktorú schválil parlament na návrh ministerstva pôdohospodárstva. Komisia uviedla, že aj táto novela má byť súčasťou auditu. Medzi akreditačnými kritériami sú totiž aj účinné opatrenia proti podvodom.